La Skoda Fabia Wagon è una utilitaria con carrozzeria station wagon che, in 4,25 metri di lunghezza, offre un buon bagagliaio e un abitacolo confortevole. L'ultima generazione di Skoda Fabia non è più disponibile con carrozzeria station wagon, dunque la Fabia Wagon si può acquistare esclusivamente sul mercato dell'usato.
La gamma di motori si limita a un 1.0 3 cilindri disponibile sia aspirato sia turbo con potenze da 60 a 110 CV. Per la versione più potente si poteva scegliere il rapido cambio automatico a doppia frizione DSG.
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