La Skoda Fabia Wagon è una utilitaria con carrozzeria station wagon che, in 4,25 metri di lunghezza, offre un buon bagagliaio e un abitacolo confortevole. Come per la Fabia berlina c’è una buona scelta di motori, da quelli più economici ai più potenti benzina e turbodiesel, alcuni abbinabili al cambio automatico a doppia frizione DSG. La Fabia Wagon è stata aggiornata nel 2015.